Répondant à l'appel de son ami Jack Dalton, MacGyver se rend en Arkansas. Là, il doit affronter les autorités locales, qui veulent se servir d'eux pour retrouver le butin caché d'un cambriolage de banque.
Une ascension en montagne tourne au drame quand une amie de MacGyver fait une chute mortelle. Mac reste isolé dans la montagne, se sentant responsable. Nikki veut lui remonter le moral mais elle croise sur son chemin un homme ressemblant à Murdoc…
MacGyver est invité à faire partie du jury d'un concours organisé par le professeur Ryman, enseignant à l'université où il a fait ses études. MacGyver retrouve David Ryman, le fils du professeur, en compétition avec trois autres étudiants sur un projet scientifique. À l'annonce des résultats du concours, MacGyver enquête...
Nikki se fait bousculer au coin d'une rue et se fait voler son portefeuille. Son agresseur est un amateur d'explosifs qui va tenter de l'éliminer.
MacGyver est chargé de récupérer une capsule de satellite contenant une expérience génétique qui s'est écrasée sur Terre. Lorsqu'il arrive sur place, il s'aperçoit que toute la faune est morte. Il va alors essayer de stopper une scientifique désireuse de poursuivre des expériences néfastes pour l'environnement.
Après une explosion lors du désarmement d'un missile nucléaire, Pete se sent responsable et donne sa démission de la fondation Phoenix. Matt Weber, qui flirte avec Nikki, en profite pour lui succéder. Mais MacGyver ne croit pas en cette coïncidence.
MacGyver prépare l'équipe nationale de hockey sur glace avec l'aide de son ex-entraîneur, Turk Donner. Toutefois, des tensions naissent au sein de l'équipe à cause d'un joueur talentueux mais sanguin, Derek Kirby, qui se montre très agressif...
MacGyver et Jack sont recrutés pour escorter une riche propriétaire de bijoux en France. Arrivés à destination, ils sont arrêtés par la police locale et accusés de complicité dans une affaire internationale de bijoux volés.
MacGyver est chargé de récupérer une capsule de satellite contenant une expérience génétique qui s'est écrasée sur Terre. Lorsqu'il arrive sur place, il s'aperçoit que toute la faune est morte. Il va alors essayer de stopper une scientifique désireuse de poursuivre des expériences néfastes pour l'environnement.
Après une explosion lors du désarmement d'un missile nucléaire, Pete se sent responsable et donne sa démission de la fondation Phoenix. Matt Weber, qui flirte avec Nikki, en profite pour lui succéder. Mais MacGyver ne croit pas en cette coïncidence.