Un double rendez-vous se termine mal lorsque Mac, Desi, Riley et son nouveau petit ami Aubrey sont témoins d'un meurtre à l'arrière du restaurant. Alors qu'ils recherchent le tueur, Riley essaie de cacher son travail à Aubrey.
MacGyver intervient dans un bâtiment allemand qui a subi une explosion, déclenchée par une bombe datant de la Seconde Guerre mondiale. Mais la menace persiste car une seconde bombe est trouvée. Mac va tout faire pour la désamorcer.
Desi infiltre une équipe de football pour démasquer une joueuse affiliée à une organisation secrète qui truque les matchs. Mais le réseau fantôme piège Desi et fait pression sur elle. MacGyver met tout en œuvre pour la sauver.
À Namur, Hélène sort sa blouse de dentiste pour une consultation originale, avant de tenter d'attraper Rose, une patiente réticente. Elle vient ensuite en aide à Molly, qui est une abonnée aux urgences vétérinaires. Les pompiers plongeurs viennent en aide à un castor. À la campagne, François fait d'étonnantes échographies, tandis qu'Audrey s'occupe d'un chat.
Dans sa clinique vétérinaire de Namur, Hélène reçoit Simone, une patiente pour le moins étonnante. Elle prend également des nouvelles de la magnifique petite lapine Kiera. Les pompiers vont secourir des chevaux bloqués avec leur calèche dans un ruisseau. Audrey tente d'apprendre les bonnes manières à un bébé chihuahua tandis que François rend visite à des moutons, ce qui ne va pas le laisser indifférent.
François vient en aide à Souki, un cheval qui souffre de coliques. À Namur, Hélène reçoit la visite de Falco, qui a besoin d'aide sans tarder. Elle prend ensuite la route pour une visite à domicile où elle va rencontrer une portée de chiots beaucerons. Les pompiers sauvent un cygne coincé dans la glace tandis qu'Audrey rencontre Léo, une vraie tornade à quatre pattes.
Hélène ausculte deux chiots nés le même jour mais dont l'un grandit plus vite, s'occupe d'un husky qui boite, d'un chat avec un abcès et rencontre la propriétaire d'une chienne pour faire le point. Elina, vétérinaire urgentiste, se rend chez un particulier dont la chienne vient de mettre bas. Audrey, comportementaliste canin, prodigue des conseils à une cliente pour faciliter les promenades difficiles avec son chien.
Hélène examine une chienne paralysée depuis deux semaines, un chien avec des ulcères aux yeux, un poulet qui perd ses plumes et vaccine les deux chats d'une cliente. Audrey a rendez-vous avec Vicky pour lui donner des conseils avec son chien à la suite de l'arrivée de son bébé. Maxence, vétérinaire urgentiste, arrive en catastrophe chez une cliente dont le chien a un problème à l'œil.
Dirigée par le commandant Steve McGarrett, le 5-0 est une unité d'élite qui combat le crime à Hawaii.
Deux jeunes Américains sont portés disparus alors qu'ils relevaient un challenge à haut risque : réaliser les épreuves les plus dangereuses d'Amérique du Sud. Toute l'équipe se lance à leur recherche et découvre les défis successifs…
Toute l'équipe est mobilisée suite à l'enlèvement de la femme et la fille d'Ethan, l'ex-mari de Matty. August Roth, auteur de ce kidnapping mais également ancien patron d'Ethan, demande en échange de leur libération la liste de tous les agents infiltrés...
Opposé à un nouvel adversaire, Mac doit faire face à un choix impossible : sauver la vie d'un ami ou bien celle de centaines de personnes innocentes…
Russ Taylor, ex agent du MI6, recrute les anciens membres de la Fondation Phoenix, Mac, Riley, Bozer, Matty et Desi, pour retrouver une arme biologique destinée à l'attaque dévastatrice contre une grande ville américaine.
Le général John Acosta recrute MacGyver pour tester la sécurité d'un laboratoire militaire, en y dérobant un projet secret. Mais l'équipe découvre que le commanditaire prévoit une attaque avec cette arme et doit alors impérativement l'arrêter.
Au retour d'une mission, l'équipe croise un avion privé dont le pilote a été victime d'une crise cardiaque. À bord, un enfant de 10 ans est toujours conscient. Mac et Daisy découvrent que tout a été prémédité.
Sarah est avocate et défend les derniers dossiers de sa mère, décédée récemment. Elle reçoit alors une invitation, qu'elle attribue à son patron, pour passer Noël dans une auberge. Elle y rencontre Ben, le charmant propriétaire, et d'autres clients qui ont reçu la même proposition. Sarah va découvrir qu'elle n'est pas là par hasard…