En mission à l'étranger pour traquer un terroriste, Jack demande à Desi Nguyen d'assurer la protection de Mac et du reste de l'équipe. Ces derniers sont chargés d'escorter, lors d'une saisie, un agent de l'ATF et son chien spécialisé dans la détection d'armes à feu.
L'équipe se fait passer pour une bande de braqueurs afin d'identifier un receleur à qui ils doivent remettre une bombe sale dérobée à un industriel russe. Charlotte Cole, cambrioleuse la nuit et mère de famille le jour, collabore en échange d'une immunité.
Au cours d'un stage de survie avec Riley et Bozer, Mac se fait kidnapper par un groupe armé ayant besoin d'un guide pour retrouver son butin en forêt. De leur côté, Jack et Matty doivent transporter Ethan Raines et sa famille dans un lieu sécurisé.
Fabrice, de la SRPA, et Sophie, du Rêve d’Aby, saisissent quatre ânes sans-abri qui se montreront plus têtus que prévu. À Liège, découvrez le refuge pour animaux de ferme « Animal sans toit », ouvert par Fabrice. Enfin, Dr Cath prêtera main forte aux équipes de Help Animals pour amener Sarah, un cochon, et Walter, un âne, dans leur nouvelle famille d’adoption.
Direction Quaregnon où Help Animals tentera de saisir une quinzaine d’animaux dont des poneys enfermés dans de terribles conditions et des chevaux qui ne se laisseront pas facilement approcher. À la SRPA de Liège, Catherine rencontre des adoptantes pour le chien Toby, déposé 2 jours après avoir été donné comme cadeau à une famille. Au refuge Le Rêve d’Aby, le cheval Pims revient d’une observation dans une clinique spécialisée car on lui soupçonnait une maladie.
Loïc se rend au refuge Help Animals pour soigner des moutons. À la SRPA de Liège, une famille vient rencontrer Nikko, un chien qui avait été adopté mais dont Fabrice avait découvert qu’il vivait attaché à une corde au fond du jardin. Enfin, Sophie du refuge Le Rêve d'Aby reviendra sur une saisie de 174 moutons.
Fabrice de la SRPA est en plein sauvetage d’un cheval fort amaigri, saisi à Awans, pour qui toute l’équipe est aux petits soins. Au refuge Help Animals, Maxime a une relation particulière et touchante avec une oie qu'il a recueillie quand elle n'était qu'un oison. Enfin, Pedro et Nono, les ânes sauvés par refuge Le Rêve d’Aby, ont retrouvé le bonheur chez un nouvel adoptant où l’âne Kikou, déjà sur place, se fera une joie de les accueillir.
Au refuge Help Animals, Ashley, un zébu plutôt têtu saisi il y a quelque temps, progresse petit à petit dans son nouvel environnement. À la SRPA de Liège, Démon, un husky perdu déposé une semaine plus tôt, retrouve son maître venu le récupérer. Au refuge Le Rêve d'Aby, ce sont de touchants adieux entre le propriétaire d'un shetland, très souffrant, et son poney dont il doit s’en séparer.
Les équipes du refuge Le Rêve d'Aby interviennent dans une maison où des cochons et cochons d'Inde sont miraculeusement rescapés. Ensuite, Dr Cath et les équipes de Help Animals se remémorent une saisie de chevaux durant laquelle ils ont recueilli Wood. Quatre ans après, Wood est adopté avec Rony, un cheval du même âge, pour compagnon. À la SRPA de Liège, le berger suisse Taylor a trouvé une maison malgré son tempérament fougueux et semble apprécier ses nouveaux maîtres.
Sur le point d'être arrêté, Wo-Fat tente de monter les membres de l'unité les uns contre les autres afin que celle-ci se désintègre. D'un autre côté, McGarrett et Danny se rendent compte que Madame le gouverneur ne les protège plus comme elle avait l'habitude de le faire, bien au contraire. McGarrett, piégé, se retrouve accusé de meurtre. Les membres du 5-0 pourront-ils prouver son innocence alors que toutes les pruves l'accablent ?
McGarett s'évade de la prison après son inculpation pour le meurtre du gouverneur. Les membres de son ancienne équipe du 5-0 le rejoignent pour retrouver le vrai meurtrier…
Une adolescente est kidnappée par les membres d'une secte. L'équipe du 5-0 part à la recherche des ravisseurs. Au même moment, un nouveau membre rejoint l'équipe de McGarett, le lieutenant Lorie Weston.
Un agent de la navy est retrouvé mort au beau milieu de la jungle. Tout semble à croire qu'il s'est suicidé, mais de nombreux indicés découvert par l'équipe du 5-0 indiquent le contraire.
Matty veut absolument que Mac et son équipe récupèrent un disque dur contenant un fichier ultraconfidentiel, dans une décharge de déchets électroniques au Ghana. Son intérêt pour cet objet intrigue toute l'équipe, qui cherche à savoir ce que cache ce mystérieux fichier appelé « DragonFly »…
Une femme agent des services secrets britanniques demande son aide à Mac pour capturer un malfaiteur très recherché. Appelé « le fantôme », ce criminel est un fabricant de bombes que MacGyver pourchasse depuis des années…
Un virus mortel au taux de mortalité de 99% est dérobé dans le centre de contrôle sanitaire d'Atlanta. Mac et son équipe doivent le récupérer au plus vite avant que le voleur ne déclenche une pandémie mondiale sans précédents.
Mac et son équipe apprennent un lourd secret sur Matty et partent sauver un agent de la CIA sous infiltration dans une affaire de trafic...
Sur la route de Las Vegas pour célébrer leurs 7 ans d'amitié, Mac et Jack sont kidnappés et se réveillent enchaînés dans un bunker. Pendant qu'ils cherchent à s'échapper, le reste de l'équipe est en infiltration pour récupérer des données gravées dans le diamant d'une princesse d'Orient…
L'équipe se fait passer pour une bande de braqueurs afin d'identifier un receleur à qui ils doivent remettre une bombe sale dérobée à un industriel russe. Charlotte Cole, cambrioleuse la nuit et mère de famille le jour, collabore en échange d'une immunité.
Au cours d'un stage de survie avec Riley et Bozer, Mac se fait kidnapper par un groupe armé ayant besoin d'un guide pour retrouver son butin en forêt. De leur côté, Jack et Matty doivent transporter Ethan Raines et sa famille dans un lieu sécurisé.
Laura et Martin sont jeunes, beaux, et riches. Mariés depuis trois ans, ils semblent former « le couple parfait » dans leur luxueuse villa au bord de l'océan. Mais sous des dehors harmonieux, leur vie conjugale est un enfer. Laura vit sous le joug despotique de Martin, subissant quotidiennement sa violence. Une anodine promenade en bateau va permettre à la jeune femme de maquiller sa fuite en accident et de recommencer une nouvelle vie...
Tous les deux jours, la liste des féminicides s'allonge inéluctablement. 124 femmes sont mortes sous les coups de leur conjoint ou de leur ex-compagnon depuis le mois de janvier. Combien encore d'ici la fin de l'année ?