Civaux (Vienne), le 20 janvier 2016. Kévin Lefebvre, 28 ans, fréquente Maud depuis deux mois. Pour impressionner sa belle, il a décidé d’enfin l’inviter à dîner chez lui. Maud est comblée… mais la jeune couturière de 28 ans est loin de se douter que son prince charmant lui a menti sur toute la ligne. D’abord, cette maison n’est pas la sienne. Pire, ce dîner cache en réalité l’effroyable crime de Chantal Delaunay, une mère de famille de 45 ans, la véritable propriétaire de la maison…
Lorsque Sébastien Megraud disparaît en mai 2013, son ex-femme Vanessa, dont il était encore très proche, a tout de suite compris que c’était grave. Jamais ce père de famille n’aurait abandonné ses deux filles Emma et Marine , alors âgées d’une dizaine d’années. La dernière fois qu’il a été vu, c’était au casino de Salies-du-Salat, un village à 1 heure au sud de Toulouse (Haute-Garonne). L’homme s’y était rendu avec un ami, dans la voiture de celui-ci. Problème, l’ami en question va donner deux versions différentes de la fin de la soirée : d’abord, il affirme l’avoir raccompagné avant de déclarer que Sébastien est en fait rentré à pied… Pourquoi s’est-il ravisé ? Tout aussi étrange : le lendemain de la disparition de son ex-mari, Vanessa pense avoir croisé Sébastien assis sur le siège passager d’une voiture, le crâne rasé. Les bandes de vidéosurveillances du casino vont confirmer que le disparu s’est bien rasé le crâne. Pour quelle raison ? S’est-il passé quelque chose pendant la soirée qui pourrait l’expliquer ?
Magnac-Laval (Haute-Vienne), le 11 janvier 2014. Peu avant minuit, un jeune pensionnaire de l’internat du Vieux-Collège découvre le corps sans vie de son surveillant, Francis Montmaud. L’homme de 58 ans gît dans l’escalier qui mène au dortoir ; il a reçu douze coups de couteaux, du thorax à la carotide. Pour les gendarmes en charge de l’enquête, ce serait forcément l’un des sept internes qui aurait fait le coup. En effet, à l’heure estimée du meurtre, tous les accès à l’internat étaient verrouillés et seul Francis en avait les clefs ! Et puis le profil des pensionnaires ne plaide pas en leur faveur : le Vieux-Collège est un centre éducatif qui accueille des adolescents retirés à leur famille… Seulement, les sept pensionnaires, âgés de 13 à 16 ans, sont unanimes : jamais ils n’auraient pu tuer Francis Montmaud. Tous appréciaient cet homme marié sans enfant qui se comportait comme un père, allant jusqu’à leur donner des cours de soutien. Alors, les enquêteurs feraient-ils fausse route ? La victime aurait-elle ouvert la porte à un inconnu alors que les jeunes étaient dans leur chambre ? Mais dans ce cas, comment le tueur aurait-il pu se volatiliser sans laisser quasiment aucune trace ?
Émeline partage sa vie avec Luc, un ancien repris de justice qui travaille comme peintre en bâtiment. Avec leurs deux enfants, le couple veut désormais croire au bonheur. Mais un soir, Luc rentre à la maison blessé. Il s'occupe de refaire des peintures pour la mairie de la ville mais semble s'être énervé et bagarré sur le chantier… Or, le lendemain, Émeline découvre dans le journal que l'adjointe au maire a été victime, la veille, d'un cambriolage qui a mal tourné et se trouve dans le coma.
Victor, père de famille, est confronté à une terrible situation sous son propre toit : du jour au lendemain, sa femme Stella et son fils Adam se mettent à lui mentir effrontément. Ils affirment que le bras cassé d'Adam est dû à une vilaine chute en VTT, puis à une bagarre au lycée, puis à une agression dans le voisinage… Pourquoi tous ces mensonges successifs autour d'un bras cassé ?
Diane Sorel est mariée depuis dix ans avec Yvan Sorel. Leur quotidien sans nuages est bouleversé par la venue d'un prêteur sur gages, accusant Yvan de lui devoir plusieurs dizaines de milliers d'euros.
Depuis l'accident d'Ariel, Allison roule en voiture de location et capte les conversations des gens via le poste radio. Elle entend notamment l'échange entre un braqueur et sa victime, sur qui le premier a fixé une ceinture d'explosifs pour l'envoyer dévaliser une banque...
Le jour où Ariel présente son petit ami Kyle à ses parents, Allison craint que celui-ci ne soit impliqué dans un meurtre. Les Dubois sont également inquiétés par Bridgette qui poste sur Internet des vidéos cocasses sur un voisin...
Après être devenue sensible à la lumière, Allison porte des lunettes de soleil qui indiquent le nombre de jours qu'il reste à vivre à ses interlocuteurs. Au cours d'un rêve, son beau-père l'alerte au sujet de la santé de Joe...
Un virus mortel et très contagieux est volé dans un laboratoire qui développait un antidote. Les visions d'Allison permettent d'enquêter sur une future attaque bio-terroriste…
Un homme suspecté d'être « Le maniaque de l'échange » - laissant le cadavre de sa précédente victime au domicile de la suivante, est tué en voulant fuir la police. Après sa mort, il entre en contact avec Allison pour prouver son innocence et délivrer des messages à sa petite amie…
Booth et Brennan enquêtent sur la mort d'un homme de petite taille, véritable star du catch. Suite à son intervention chirurgicale, Booth passe un test de tir. Il réalise alors qu'il n'est plus un aussi bon tireur d'élite qu'avant et va consulter son ami, le docteur Gordon Wyatt.
Lors d'une visite, un agent immobilier découvre un cadavre consumé dans une maison à vendre. Au cours de l'enquête, l'équipe de l'Institut Jefferson met en évidence deux corps à identifier. Par ailleurs, Booth accueille son grand-père Hank qui l'accompagne tout au long de l'investigation.
Booth et Brennan enquêtent sur la mort d'un facteur, devenu champion du monde d'un jeu vidéo vintage. La victime concentrait tant d'admiration et de jalousie depuis sa victoire que les suspects et les mobiles ne manquent pas.
À la veille des fêtes de fin d'année, Booth et Brennan planchent sur le cas d'un homme qui a tenté de dévaliser une banque déguisé en père Noël. Pendant ce temps, Brennan organise un dîner de Noël à la demande de son père, qui lui présente sa cousine, Margaret.
Booth et Brennan sont appelés à identifier une femme, passionnée d'ovnis et retrouvée sans vie dans le désert du Nouveau Mexique, près de Roswell. À l'Institut Jefferson, Angéla et Wendell décident de ne plus cacher leur relation à Hodgins.
L'équipe de l'Institut Jefferson est réquisitionnée par le gouvernement pour déterminer la cause d'un décès classé top-secret. En attendant, personne n'est autorisé à sortir du laboratoire. Avec l'aval de son supérieur, Booth entre par effraction pour en savoir plus.
Booth et Brennan se rendent sur un site historique de la Guerre Civile où un squelette a été trouvé. Brennan indique que les os appartiennent à un dentiste de l'époque, reste la cause du décès à déterminer. De retour d'Inde, Jared présente sa fiancée, Padme, à Booth.
L'équipe de l'Institut Jefferson examine le corps d'un jeune homme ressemblant étrangement à celui du diable décrit dans les textes bibliques. Après identification de la victime, patient d'un hôpital psychiatrique, Booth découvre une longue liste de suspects.
Après un séisme, l'eau des canalisations envahit le métro et charrie le corps d'un homme décédé il y a une semaine. Pendant que Booth mène son enquête, Sweets, présent lors de la catastrophe, souffre d'un stress post-traumatique. De son côté, Brennan savoure le succès de son second livre.
À la demande du docteur Sweets, Booth et Brennan relatent leur rencontre. Ils évoquent également leur première enquête et collaboration avec l'équipe de l'Institut Jefferson.
Dans la forêt de Brocéliande, un adolescent mutique est retrouvé à proximité d'un corps calciné, impossible à identifier. Marie Delorme et Éric Jourdain, un couple de gendarmes au bord de la rupture, sont en charge de l'enquête. En état de choc, le garçon de 13 ans est incapable de parler. Il dessine cependant. Ses dessins ressemblent aux légendes locales liées au mythe de Merlin l'Enchanteur. Le frère de Marie, pédopsychiatre aux méthodes originales, tente de faire parler l'enfant, persuadé qu'il a été témoin des faits.