Dans la famille Sullivan, la tradition veut que les fiancés se marient à Noël et que la mère de la mariée offre un patchwork fait de ses mains au couple. Leur mère étant décédée, Liam décide d’offrir un patchwork à sa sœur Lauren, sur le point d’épouser Jack. Liam fait appel à Amy, qui donne des cours de couture dans un centre culturel. Devenus très complices, leur idylle naissante va être fragilisée par un projet de voyage que Liam a repoussé dix ans plus tôt lorsqu’il a perdu ses parents…
Addison Tate est la principale du collège de la petite ville de Mission City. Cette année, Noël sera différent car l'établissement risque de fermer en raison de coupes budgétaires. Afin de sauver son école et mobiliser des donateurs, Addison fait alors appel à Dylan Davidson, son premier amour devenu star de cinéma, pour faire la mise en scène du spectacle de Noël...
À son retour de vacances, Marie-France, 48 ans, a décidé de passer quelques jours chez son fils Antoine, 26 ans, sa belle-fille Léna et son petit-fils de deux ans Léon. Sa déception est grande quand Marie-France apprend qu'elle ne pourra voir ni Léon ni Léna parce qu'ils sont « restés en week-end ». Mais tout s'écroule quand Marie-France comprend qu'Antoine lui a menti et qu'en réalité Léon et Léna ont disparu…
Clémence vient d'enterrer son père, Alain Picard, homme d'affaires prospère atteint d'un cancer. Le souvenir que la famille garde d'Alain va pourtant voler en éclats lorsqu'une certaine Claire Genest, 32 ans, prétend un jour être sa fille cachée.
Karine élève seule sa fille Océane, 16 ans et sans histoire… Du moins c'est ce que croyait Karine avant que des policiers débarquent chez elle pour questionner l'adolescente. Dany, le patron de la boutique où Océane travaille le samedi, a été victime d'une agression et les policiers veulent savoir si la jeune fille a déjà vu le suspect, un voyou du nom de Dimitri. Océane nie le connaître… Seulement Karine a déjà aperçu ce type en compagnie de sa fille…
Chelsea développe une application qui permet de trier les bonnes et les mauvaises personnes, mais son idée a été volée par sa collègue. Sa vie est chamboulée par l'arrivée de la Mère Noël, directement du pôle Nord, dont l'aide « magique » est précieuse. Le seul réconfort face à ces situations : passer du temps avec son voisin Fisher, qui, comme Chelsea, a une passion pour Noël…
Laney est une star de la chanson country, mais sa carrière est sur le déclin et pour revenir sur le devant de la scène, elle accepte un concert de Noël à New York, ce qui signifie qu'une fois de plus, elle ne passera pas les fêtes avec sa mère dans son village natal. Sur le trajet, elle est bloquée par la neige et croise son ex amour de jeunesse Robbie, qui la ramène chez elle. Les retrouvailles sont électriques, mais c'est l'occasion idéale pour se rapprocher…
Depuis la disparition de ses parents, AlexiaTaylor dédie tout son temps à son travail et passe Noël toute seule. Cette année pourtant, elle va recevoir un cadeau qui va bouleverser sa vie : un voyage dans le passé. Alexia va alors se réconcilier avec l'esprit de Noël et enfin laisser une place à l'amour dans sa vie.
Sept mois après avoir quitté les États-Unis, le docteur Brennan et l'agent Booth se retrouvent à Washington à la demande de Caroline. La réputation et la carrière du docteur Camille Saroyan sont en jeu. L'équipe de l'Institut Jefferson, partie aux quatre coins du monde, se reconstitue alors pour identifier le corps d'un enfant dont la disparition fait polémique. Mais rien n'est plus vraiment comme avant : Angela et Hodgins attendent un enfant, Sweets et Daisy sont émus de se revoir et Booth avoue à Brennan avoir fait la rencontre d'une journaliste sur le front afghan...
Les restes d'un couple sont retrouvés dans une grotte située dans un parc national. Une fois les victimes identifiées par l'équipe du docteur Brennan, Booth dispose de très peu de suspects à interroger. Durant l'enquête, l'agent reçoit la visite surprise de sa petite amie Hannah, qui a demandé son affectation à Washington. L'arrivée de la journaliste laisse Brennan incertaine quant à ses relations avec Booth...
Le corps sans vie d'un jeune homme de 23 ans a été retrouvé sur une plage du New Jersey, près d'une boîte de nuit. Contrairement à l'agent Booth, Brennan est à l'aise dans l'univers très looké des guidos auquel appartenait la victime. Pendant ce temps, Booth propose à Hannah d'emménager avec lui et Angela tente de garder secret l'heureux événement qu'elle attend...
La tête d'un chasseur de primes est retrouvée dans une benne à ordures. L'homme traquait un meurtrier, mais n'était pas le seul à convoiter la caution d'un million de dollars pour l'arrestation. Le temps de l'enquête, un célèbre animateur d'émission scientifique pour enfants devient l'assistant du docteur Brennan, qui en échange, sera l'invitée d'un numéro spécial tourné à l'Institut Jefferson...
Lorsque le squelette d'un danseur est retrouvé sur un chantier, incrusté dans du béton, l'agent Booth et le docteur Brennan interrogent des artistes de rue, que la victime avait rejoint après avoir quitté le ballet classique. Dans une banlieue malfamée de Washington, Hannah réalise un reportage sur des policiers corrompus et met sa vie en danger...
Le conseil d'administration demande à l'Institut Jefferson d'identifier les victimes du Amélia Rose, navire négrier coulé au large des côtes du Maryland, il y a 150 ans. Parmi les corps, on recense celui d'un jeune homme de 19 ans, mort le mois dernier. L'enquête mène l'agent Booth et le docteur Brennan à embarquer sur un navire spécialisé dans les croisières-rencontres pour femmes cougars...
Lors d'un salon culinaire, le corps d'une femme est retrouvé dans la plus grande tablette de chocolat du monde, confectionnée par un célèbre confiseur. L'agent Booth découvre que la victime cumulait mensonges, secrets et relations amoureuses ; autant de mobiles sérieux pour un meurtre. Pendant ce temps, Angela et Hodgins organisent une réception pour annoncer leur heureux événement et Camilla tente de persuader Michelle de choisir une université proche de Washington...
Un squelette fondu dans la carrosserie d'un pick-up donne du fil à retordre à l'équipe de l'Institut Jefferson. Après plusieurs hypothèses émises sur les circonstances de la mort, l'agent Booth oriente son enquête vers l'épouse de la victime, professeure, et un de ses élèves. Pendant ce temps, Booth organise la première rencontre entre son fils Parker et Hannah...
L'investigation sur le meurtre d'une chirurgienne émérite ébranle la légendaire objectivité du docteur Brennan. Les ressemblances sont si troublantes entre elle et la victime, que l'anthropologue va jusqu'à remettre en cause ses propres choix de vie et avouer ses sentiments à Booth...
Le corps d'une femme est découvert dans la douche d'une villa luxueuse. Les analyses de l'Institut Jefferson montrent que la victime n'est pas la propriétaire, mais une employée, travaillant pour un fournisseur de marchandises contrefaites. Pendant l'enquête, l'agent Booth révèle à Hannah les sentiments forts que le docteur Brennan ressent pour lui. Angela et Hodgins achètent une maison pour fonder leur famille...
Jeannette et Zane, le célèbre chanteur de country, sont de retour de leur lune de miel pour passer les fêtes avec Quinn, la fille de Jeannette. Zane vient de recevoir l'autorisation d'adopter Quinn et souhaite lui faire la surprise le jour de Noël. Mais l'arrivée du grand-père paternel, qui est contre la relation de sa fille avec le chanteur, va perturber ses plans…